ความหลากหลายในการใช้ข้อมูลดีเอ็นเอของเชื้อรา Lasiodiplodia sp. เพื่อการจำแนกเชื้อ
ชัยณรงค์ รัตนกรีฑากุล และพิมพ์รัมภา เปี่ยมสกุล
วารสารวิทยาศาสตร์เกษตร 45 (3/1 พิเศษ): 157-160. 2557.
2557
บทคัดย่อ
ทำการตรวจสอบความหลากหลายของเชื้อราสาเหตุโรคขั้วผลเน่า โดยใช้เชื้อราตัวแทนที่มีลักษณะโคโลนีใกล้เคียงกับเชื้อรา Lasiodiplodia theobromaeจากแปลงผลิตมะม่วงในพื้นที่ผลิตต่างกัน จำนวน 3ไอโซเลท คือ L4 L5 และ L7จากการศึกษาลักษณะการเจริญเติบโตของเชื้อราบนอาหาร PDA พบว่า เชื้อรา L. theobromaeL7เจริญเติบโตได้ดีกว่า L4 และ L5 สำหรับลักษณะเส้นใยของเชื้อรา L5 มีลักษณะสีขาวอมเทาฟูคล้ายกับเส้นใยของเชื้อรา L7 เมื่อนำข้อมูลดีเอ็นเอของเส้นใยเชื้อรามาตรวจสอบส่วนของ Internal transcribed spacer ด้วยเทคนิคพีซีอาร์ ใช้ไพรเมอร์ ITS1และ ITS4 วิเคราะห์หาลำดับเบส ตรวจสอบความเหมือน และเทียบกับฐานข้อมูลดีเอ็นเอของเชื้อรา พบว่า L5กับ L7มีข้อมูลลำดับเบสบางส่วนที่เหมือนกันและใกล้เคียงกับเชื้อราNeofusicoccum parvum สำหรับเชื้อรา L4 มีลำดับเบสใกล้เคียงกับเชื้อราBotryosphaeria dothidea ผลจากการตรวจสอบครั้งนี้ทำให้ทราบว่า การใช้ข้อมูลลำดับเบสเพื่อตรวจสอบชนิดของเชื้อรามีโอกาสผิดพลาด จากความไม่สมบูรณ์ของฐานข้อมูล และมีโอกาสที่จะพบโรคขั้วผลเน่าจากเชื้อราอื่นๆที่อยู่ในตระกูล Botryosphaeriaceaeได้